10 февраля пресс-служба Соцпартии, членом которой является Н.Рудьковский, распространила официальное сообщение, в котором сказано, что во время задержания бывший министр, возможно даже, находился без сознания. Как сообщила В.Бутенко, ни членам семьи, ни адвокатам Н.Рудьковского неизвестно его местонахождение, в связи с чем родственники уже обратились в прокуратуру Киева с заявлением о похищении бывшего министра транспорта.
Лечащий врач Н.Рудьковского, заведующий стационарным отделением клиники "Борис" Игорь Конивец подтвердил, что в день, когда произошло задержание, Н.Рудьковский находился в клинике. По его словам, 7 февраля Н.Рудьковского прооперировали, а 9 февраля разрешили полупостельный режим – он мог 15 мин. в день прогуливаться по клинике. "По просьбе пациента был вызван консультант-нейрохирург из Цюриха. После консультации мы с нейрохирургом уединились, а через 15 минут охрана мне сообщила, что пациент, отойдя на несколько метров от клиники, был похищен какими-то людьми", – сообщил врач. Состояние министра врач оценил как среднетяжелое.
В СБУ не отрицают, что задержание проводилось силами оперативных сотрудников их ведомства, однако настаивают, что не на территории клиники. По словам заместителя руководителя СБУ Николая Герасименко, к Н.Рудьковскому на пр.Бажана в Киеве подошли двое оперативников, которые, показав удостоверения, предложили проехать к следователю, после чего бывший министр, не сопротивляясь, сел в машину.
По информации издания, разрешение Печерского райсуда г.Киева на задержание Н.Рудьковского, подозреваемого в растрате государственного имущества, было получено еще 2 февраля. По словам прокурора Киева Евгения Блаживского, после задержания Н.Рудьковский был доставлен в следственный изолятор СБУ, где и будет находиться до заседания суда. Справка "SQ". 14 сентября 2007 г. СБУ обратилась в Генпрокуратуру с представлением о возбуждении уголовного дела в отношении Н.Рудьковского за распространение заведомо неправдивой информации: в прямом телеэфире 4 сентября 2007 г. он заявил, что секретариат президента якобы готовит масштабную катастрофу с человеческими жертвами. Дело не было возбуждено, поскольку Генпрокуратура не нашла в действиях Н.Рудьковского состава преступления.
В начале декабря 2007 г. СБУ заявила о возбуждении уголовного дела в отношении Н.Рудьковского по ч.5. ст.191 УК ("растрата имущества в особо крупных размерах путем злоупотребления служебным положением"), предусматривающей лишение свободы сроком до 12 лет с лишением права занимать определенные должности и конфискацией имущества. 14 декабря он был вызван на допрос в связи с расследованием дела о растрате 392,9 тыс.грн государственных средств на оплату личного чартера в Париж и обратно с 9 по 12 июня 2007 г. 24 декабря 2007 г. завершилось расследование по этому делу и было предъявлено обвинение. Н.Рудьковскому инкриминируется также чартер в Брюссель, обошедшийся Минтрансу в 98 тыс.долл.
24 января 2008 г. в прокуратуру Киева были переданы материалы о предполагаемой незаконной растрате Н.Рудьковским бюджетных средств в размере 122 тыс.грн на оплату визита делегации Минтранса в столицу Японии Токио с 7 по 13 июля 2007 г.
8 февраля 2008 г. МВД заявило, что в IV квартале 2007 г. Н.Рудьковский с нарушением законодательства разрешил отчуждение объектов недвижимости 36-го объединенного отряда Государственной специальной службы транспорта, что нанесло госбюджету ущерб в размере 8,5 млн.грн.